El Órgano de Control Institucional, es el encargado de programar, ejecutar y evaluar las acciones de control educativo, administrativo, financiero y de investigación en el ámbito de la Unidad de Gestión Educativa Local Nº 06, y depende de la Dirección de la UGEL.

Las funciones del Órgano de Control Institucional son:

• Formular, ejecutar y evaluar el Plan Anual de Control, de conformidad con la política y planes de control de las instancias correspondientes de la Dirección regional, Sede Central del ministerio de Educación y las normas de la Contraloría general de la República.
• Realizar las acciones de seguimiento que corresponda, cautelando la ejecución de medidas correctivas y/o sanciones dispuestas por el titular de la Entidad, para mejorar la gestión y para la prevención y sanción de actos de corrupción de la gestión pública.
• Organizar y ejecutar las acciones de control posterior que específicamente le encargue el titular de la UGEL y los organismos superiores de control.
• Elaborar los informes de control interno y levarlos a la Dirección de la UGEL, la Contraloría General de la república y otras instancias según corresponda.
• Investigar las denuncia presentadas a l Órgano de Control Institucional por terceras personas, informando sobre los resultados al titular de la UGEL, para que se tomen las medidas correctivas pertinentes.
• Proponer e implementar mecanismos de prevención y sanción para los actos de corrupción en la gestión administrativa.
• Cautelar la calidad y oportunidad de sus procedimientos, mecanismos y acciones de control, con el objeto de cumplir a cabalidad la función que le compete.
• Cumplir diligentemente con los encargos y requerimientos que le formule la Contraloría General de la República.